推动专业机构改建，是本次科技计划管理改革的重点任务之一。国家科技计划（专项、基金等）管理部际联席会第一次、第三次全体会议先后审议了专业机构改建工作方案、遴选原则标准。9月29日，部际联席会第四次全体会议召开，对专业机构专家咨询论证结果进行审议。
    会上，科技部汇报了专业机构前期工作及专家咨询论证会情况。前期，部际联席会议办公室印发通知，请各成员单位推荐申报科研项目管理专业机构，共有15个成 员单位推荐了24家单位申报专业机构。科技部、财政部、发展改革委根据联席会确定的遴选原则和标准进行了初审，16家单位通过初审，参加了专家咨询论证 会。咨询论证组由特邀咨评委成员以及来自国务院发展研究中心、中科院、工程院、自然科学基金会、中国科协等单位的专家组成，通过书面材料审阅和会议咨询评 审，对16家单位是否具备承担项目管理任务资格以及能否启动改建工作提出了论证意见，并建议科技部等部门加强改建工作顶层设计、控制专业机构总量、推动专 业机构整合、明确专业机构职责定位与运行机制等。
    会议确定先行启动基础条件较好的7家管理类事业单位的改建工作，部际联席会召集人提出了工作要求。科技部万钢部长指出，要按照专业机构专家咨询论证结果， 抓紧部署开展专业机构改建工作，指导专业机构做好项目管理工作，提升专业机构的专业水平和服务能力，不断推进专业机构的专业化、社会化。财政部余蔚平副部 长提出，结合专业机构的机构人员情况和项目管理任务状况，研究对专业机构的经费保障措施，支持专业机构开展项目管理工作。发展改革委林念修副主任提出，建 立健全专业机构配套规章制度，统筹谋划专业机构社会化试点工作，尽快推动专业机构与2016年重点专项管理任务对接。
    目前，各相关单位正按照会议精神和专家咨询论证意见，进一步完善改建方案，筹备启动改建任务，为参与国家科技计划项目管理做好相关准备工作。